A equipe do Cruzeiro Esporte Clube - Nucleo Oficial São José do Rio Preto, foi fundada em 09/09/2011, em Ruilândia distrito da cidade de Mirassol.
A equipe foi fundada, para receber apenas atletas abaixo de 18 anos. Em menos de 1 ano, a equipe foi transferida para São José do Rio Preto, e teve mudanças drásticas.
A equipe perdeu patrocinios e alguns atletas importantes. Mais o presidente Paulo Henrique Rosa, manteve a cabeça no lugar e decidiu fazer uma equipe que participasse apenas de campeonato Varzeano e Amador. A equipe manteve a base do primeiro time sub-20.
A equipe entrou em 2 campeonatos Amadores. Ambos em Mirassol. No primeiro campeonato, a equipe saiu nas quartas-de-final perdendo o jogo de 1 a 0. No segundo ano a equipe veio mais forte e mais unida... Vice-Campeões, perdendo apenas na final...
O time, sempre foi considerado uma equipe jovem, por ter seus jogadores mais velhos entre 27 e 32 anos, e os outros até 20 anos.
CRUZEIRO ESPORTE CLUBE. Raça, Força, União e Vitória. Esse é o lema.